Está formado por los documentos producidos y recibidos en el desarrollo de sus funciones por los obispos, arzobispos y curia diocesana de San José, más los documentos de la antigua Vicaría Foránea de Cartago.
Contiene libros de actas, correspondencia recibida y enviada y libros de cuentas, junto con otras series documentales menos voluminosas.Aproximadamente la mitad del fondo documental es de naturaleza contable.