Parroquia erigida el 11 de diciembre de 1880 por Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, segregándose del territorio de la Parroquia de Escazú (Libro de Acuerdos número 4, folio33, asiento 48, y folio 34, asiento 49; y Fondos Antiguos, caja 206, folios 15-46).
Parroquia erigida el 1 de setiembre de 1863 por Monseñor Anselmo Llorente y Lafuente (Fondos Antiguos, Caja 135, folios 12-15v).
El 16 agosto de 1954 Monseñor Rubén Odio Herrera, III Arzobispo de San José, dio el decreto de erección de la Coadjutoria Territorial de San Rafael de Calle Blancos, a partir de territorios de las parroquias de Santa Teresita en San José y Nuestra Señora de Guadalupe en Goicoechea (Libro de Acuerdos número 12, folio 40, asiento 109). Al año siguiente, el dos de febrero de 1955, a raíz de la creación de la coadjutoría de San Agustín en Cinco Esquinas de Tibás, se modificaron los límites de San Rafael de Calle Blancos, incluyéndose dentro de estos “el distrito de San Francisco de Guadalupe en la parte perteneciente a la Parroquia de Santa Teresita” (Libro de Acuedos 12, Folio 55, Asiento 6).
El 4 agosto de 1960 Monseñor Carlos Humberto Rodríguez Quirós erigió la Parroquia de San Rafael de Calle Blancos, conjuntamente con la de Santa Bárbara de Pavas (San José), señalando como fecha de inauguración el mismo día del decreto (Libro de Acuerdos número 12, folio 271, asiento 35).
Parroquia erigida el 2 enero de 1865 por Monseñor Anselmo Llorente y La Fuente (Fondos Antiguos, caja 145, Expediente 474, folios 240 y 243).
Guadalupe es Parroquia desde el 15 de octubre de 1856 a raíz del nombramiento del presbítero José María Brenes como Cura interino de Guadalupe y su aprobación por el Presidente de la República (Fondos Antiguos, caja 80, folio 395; Libro 1° de Bautismos, folio 145, asiento 249).
Parroquia erigida el 26 de diciembre de 1881, segregada de la parroquia de San Vicente Ferrer en Moravia (Fondos Antiguos, caja 285, folios 361v-364v).
Aserrí es orignariamente una doctrina de indios creada 1575. Aserrí fue visitado por Monseñor Pedro Morel de Santa Cruz, Obispo de Nicaragua y Costa Rica, en su visita pastoral de 1751, mencionando como patrono de este pueblo a San Luis. Sus libros sacramentales se conservan desde 1782.
El templo actual se empieza a construir en 1885.
Desde inicios del siglo XIX, en el actual asentamiento del cantón de Desamparados, existió una población denominada Dos Cercas. Hacia 1821 ya tenía una ermita donde unos años mas tarde, por una donación del presbítero José María Esquivel, fue llevada una imagen de María bajo la advocación de Nuestra Señora de los Desamparados. Su devoción tuvo una gran acogida y pronto Dos Cercas pasó a llamarse Desamparados.
Este templo empezó a llevar libros sacramentales desde 1825 como filial de San José. En 1852, los vecinos solicitaron a Monseñor Anselmo Llorente y Lafuente, I Obispo de San José, la erección de la parroquia, siendo finalmente erigida el 1 de julio de 1853 (Fondos Antiguos, caja 89, folios 17-21).
En el año 1829 se menciona la ermita de Santo Domingo.
Fue creada Parroquia el 23 agosto de 1854 por Monseñor Anselmo Llorente y Lafuente, I Obispo de San José.
El 23 julio 1891, Monseñor Bernardo Augusto Thiel, II Obispo de San José, consagró el templo y entregó el título de Basílica, título que debía ser renovado periódicamente (Fondos Antiguos, Caja 400A, fs. 5-6).
En 1863 se construyó la primera ermita, que en 1866 fue ascendida a filial de la Parroquia de Heredia y eleva al rango de Parroquia el 3 julio 1886.
La construcción del actual templo neogótico es responsabiliad del Párroco Rosendo de Jesús Benavides y del arquitecto Lesmes Jiménez.
El Templo fue consagrado por Monseñor Carlos Humberto Rodríguez Quirós, IV Arzobispo de San José, el 25 febrero 1962, siendo Párroco el presbítero Miguel Ángel Arguedas Molina.